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办公地址：
北京大学王克桢楼209号房间
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电子邮箱：
lei.ma@pku.edu.cn
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个人网页：
http://maleilab.cn
马雷
- 研究员、博士生导师
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北京大学未来技术学院、国家生物医学成像科学中心
数字生命模拟研究室主任
多模态跨尺度生物医学成像设施装置四负责人
北京市杰出青年科学基金
北京智源人工智能研究院 智源学者
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- 个人简介
- 实验室主要从事计算机图形软件、人工智能与生命科学交叉方向研究。当前努力从计算角度推动“数字生命”科学理念和实践。共计发表文章70余篇。其中第一或通讯（含共同）发表30+篇文章，包括国际期刊学术论文如多模态数据驱动的整合秀丽线虫模型“天宝”（Nature Computational Science, 2024, 封面文章）、精细神经元动力学快速求解(Nature Communications, 2023)、SCN神经元集群时间编码模型(Cell Research, 2024, 封面文章)、“数字肾脏”科学计划（National Science Review, 2025），以及人工智能、计算机视觉等方向国际会议如NeurIPS、CVPR、AAAI、MICCAI、ECCV、ACM MM等。他的科研成果多次获新华社、人民日报、CCTV和北京电视台报道。他主持“人工智能重大科技专项”课题（2022）、北京市科技计划（2023）、北京市杰出青年科学基金（2024）、北京市非共识创新项目（第一批、2025）等多个重要项目。
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- 所授课程
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《生物医学数据可视化技术》（通选课，2学分）、
《数字生命导论》（筹）
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- 个人履历
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2022-今 北京大学未来技术学院 副研究员、研究员
2019-2024 北京智源人工智能研究院 兼聘研究员、生命模拟研究中心负责人
2019-2022 北京大学信息科学技术学院计算机系 副研究员（现计算机学院）
2012-2014 中视典科技数字科技、适图数字科技有限公司 研发总监、CTO
2010-2012 欧特克软件（Autodesk）图形工程师
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- 教育背景
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2016-2016 香港中文大学 访问交流
2013-2019 中国科学院软件研究所 博士
2007-2010 上海交通大学 硕士
2003-2007 浙江大学 本科
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- 团队成员
- 王文耀、苏峰等
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- 承担项目
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2025-2025 北京市非共识创新项目（第一批） 主持
2024-2026 北京市杰出青年科学基金项目 主持
2023-2026 北京市科技计划项目 主持
2022-2025 科技部“人工智能重大科技专项”课题 主持
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- 代表性论文及论著
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1. An integrative data-driven model simulating C. elegans brain, body and environment interactions. Mengdi Zhao, Ning Wang, Xinrui Jiang, Xiaoyang Ma, Haixin Ma, Gan He, Kai Du, Lei Ma*, Tiejun Huang. Nature Computational Science, 2024 (Cover Story)
2. System-level time computation and representation in the suprachiasmatic nucleus revealed by large-scale calcium imaging and machine learning. Zichen Wang, Jing Yu, Muyue Zhai, Zehua Wang, Kaiwen Sheng, Yu Zhu, Tianyu Wang, Mianzhi Liu, Lu Wang, Miao Yan, Jue Zhang, Ying Xu, Xianhua Wang, Lei Ma*, Wei Hu* , Heping Cheng*. Cell Research, 2024 (Cover Story)
3. Cost-effective instruction learning for pathology vision and language analysis. Kaitao Chen, Mianxin Liu, Fang Yan, Lei Ma, Xiaoming Shi, Lilong Wang, Xiaosong Wang, Lifeng Zhu, Zhe Wang, Mu Zhou & Shaoting Zhang*. Nature Computational Science (2025).
4. An initiative on digital nephrology: the Kidney Imageomics Project. Fangxu Zhou, Zehua Li, Haifeng Li, Yao Lu, Linjia Cheng, Ying Zhang, Zichen Wang, Jing Nie, Heping Cheng, Bin Dong* , Lei Ma*, Li Yang*. National Science Review, 2025
5. Embedded prompt tuning: Towards enhanced calibration of pretrained models for medical images. Wenqiang Zu#, Shenghao Xie#, Qing Zhao#, Guoqi Li, Lei Ma*. Medical Image Analysis, 2024
6. A GPU-based computational framework that bridges Neuron simulation and Artificial Intelligence. YC Zhang, G He, L Ma, X Liu, JJ Hjorth, A Kozlov, Y He, S Zhang, JH Kotaleski, YH Tian, S Grillner, K Du, TJ Huang. Nature Communications. 2023
7. Coherent chord computation and cross ratio for accurate ellipse detection. Pattern Recognition, M Zhao, X Jia*, Lei Ma*, LM Hu, DM Yan. Pattern Recognition, 2024
8. Accurate Registration of Cross- Modality Geometry via Consistent Clustering. Mingyang Zhao, Xiaoshui Huang, Jingen Jiang, Luntian Mou, Dong-Ming Yan*, Lei Ma*. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2023
9. GraphReg: Dynamical Point Cloud Registration with Geometry-aware Graph Signal Processing. Mingyang Zhao, Lei Ma*, Xiaohong Jia, Dong-Ming Yan*, Tiejun Huang. IEEE Transactions on Image Processing，2022
10. Structure inference of networked system with the synergy of deep residual network and fully connected layer network. Keke Huang, Shuo Li, Wenfeng Deng, Zhaofei Yu, Lei Ma*. Neural Network. 2022