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陈匡时

  • 副教授、博士生导师
  • 北京大学未来技术学院生物医学工程系
    北京大学国家生物医学成像科学中心（兼）
  • 个人简介
    主要研究方向为核酸纳米生物技术。近五年发展了一系列可在细胞中研究或调控生物学过程的方法。在纳米探针方面，研制出了一种新型的分子信标纳米探针修饰方法，克服了传统分子信标因无法在活细胞中保持稳定而标记效率低的问题，实现了在活细胞中对目标RNA进行单分子标记以及动力学特征检测；通过将CRISPR系统与分子信标相结合，克服了传统探针无法高效、高灵敏度成像特定染色质位点的问题。在纳米显微成像方面，利用单分子荧光显微成像技术在纳米尺度下对数千个HIV结构蛋白组装成病毒颗粒这一生物学过程做出精细的解析；发展了新型互作成像技术揭示了宿主细胞蛋白在病毒组装中的作用。在纳米材料自组装技术方面，开发了以具有特殊结构的小RNA为模块的多价RNA纳米器件用于抗HIV-1病毒组装。近五年作为独立通讯作者的相关研究成果已在Nucleic Acids Research、ACS Nano、Protein & Cell、Proc Natl Acad Sci U S A等期刊上发表论文。
  • 所授课程
    《生物医学工程概论》 （研究生必修，3学分）
    《细胞与分子影像学》 （本科生选修，3学分）
  • 教育背景
    2004-2008， 博士：宾夕法尼亚大学 (University of Pennsylvania) 专业：生物医学工程 （导师： Andrew Tsourkas）
    2000-2002， 硕士：加州大学-圣地亚哥校区 (UC San Diego) 专业：生物医学工程
    1996-2000， 学士：加州大学-圣地亚哥校区 (UC San Diego) 专业：生物医学工程
  • 工作简历
    2021.1-现在 北京大学未来技术学院生物医学工程系研究员、长聘副教授
    2019.8-2020.12 北京大学工学院生物医学工程系研究员、长聘副教授
    2013.4-2019.7 北京大学工学院生物医学工程系特聘研究员、助理教授
    2010.3-2013.3 美国国家卫生研究院 (NIH)，Jennifer Lippincott-Schwartz 实验室，博士后
    2010.3-2012.3 美国国家标准与技术研究院 (NIST)，Anne L. Plant 实验室，博士后
    2009.1-2010.1 美国宾夕法尼亚大学，Andrew Tsourkas 实验室，博士后
  • 承担项目
    2022.01–2026.06 干细胞命运决定过程中胞核无膜颗粒小体的结构、定位、组成成分及其动态变化研究（科技部国家重点研发计划课题） 课题负责人
    2022.01–2025.12 活细胞中线粒体RNA实时可视化技术平台的建立和应用研究（国家自然科学基金面上项目） 课题负责人
    2017.01–2021.12 活细胞单分子成像内源RNA技术（国家自然科学基金面上项目） 课题负责人
    2016.07–2021.07 活细胞中蛋白质机器构象改变实时观测技术（科技部国家重点研发计划课题） 课题负责人
    2016.07–2021.07 非编码 RNA 介导的染色质高级结构动态变化对神经细胞谱系命运决定的调控功能及分子机制（外胚层）（科技部国家重点研发计划课题） 课题骨干
    2016.01–2018.12 引入Pentabase的分子信标再活细胞中的功能性研究与应用（北京市自然科学基金面上项目） 课题负责人
    2014.01–2017.12 新型分子信标研究及其在活细胞内HIV-1病毒RNA成像的应用（国家自然科学基金面上项目） 课题负责人
  • 代表性论文及论著
    1. Qu, N., Ying, Y., Qin, S., and Chen, A.K.* Rational design of self-assembled RNA nanostructures for HIV-1 virus assembly blockade. Nucleic Acids Res. 2022;50(8):e44.
    2. Mao, S., Ying, Y., Zhao, M., Yang, Y., and Chen, A.K.* A Background Assessable and Correctable Bimolecular Fluorescence Complementation System for Nanoscopic Single-Molecule Imaging of Intracellular Protein-Protein Interactions. ACS Nano. 2021；15, 14338-14346.
    3. Mao, S., Ying, Y., Wu, X., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* CRISPR/dual-FRET molecular beacon for sensitive live-cell imaging of non-repetitive genomic loci. Nucleic Acids Res. 2019; 47, e131.
    4. Yang, Y., Qu, N., Tan, J., Rushdi, M.N., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* Roles of Gag-RNA interactions in HIV-1 virus assembly deciphered by single-molecule localization microscopy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018; 115, 6721-6726.
    5. Wu, X., Mao, S., Yang, Y., Rushdi, M.N., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* A CRISPR/molecular beacon hybrid system for live-cell genomic imaging. 2018; Nucleic Acids Res, 46, e80.